Αρχαιοκάπηλοι εκμεταλλεύτηκαν τις πολιτικά αβέβαιες συνθήκες μετά την τουρκική εισβολή, διέρρηξαν την εκκλησία της Παναγίας Κανακαριάς και αφαίρεσαν σχεδόν πλήρως το μωσαϊκό από τον τοίχο αλλά και από Εκτός από την πολλές άλλες εκκλησίες ιερα αντικείμενα εξαφανίστηκαν.
