Ο κ. Κονιδάρης τόνισε ότι ο π. Αντώνιος είχε αρνηθεί τόσο στον μακαριστό Αρχιεπίσκοπο κυρό Χριστόδουλο όσο και στον Αρχιεπίσκοπο κ.κ. Ιερώνυμο οποιαδήποτε υπαγωγή στην Αρχιεπισκοπή Αθηνών, στην οποία ο ίδιος ανήκει οργανικά.
Στην αντεπίθεση πέρασε ο αρχιεπίσκοπος Ιερώνυμος για την υπόθεση της "Κιβωτού του Κόσμου" - «Η Εκκλησία δεν πρόκειται να συγκαλύψει επαίσχυντες και ειδεχθείς συμπεριφορές που λερώνουν το ιερό ράσο»
Η ιερατική του πορεία π. Αντώνη Παπανικολάου άρχισε το 1998 ως εφημέριος στον Άγιο Γεώργιο Ακαδημίας Πλάτωνος, στον Κολωνό.
Η συνέχεια εντυπωσιακή. Μαζί με τη συζυγό του Σταματία Γεωργαντή και με τη βοήθεια εθελοντών, δημιουργήθηκε η Κιβωτός του Κόσμου (το 1998), μια Οργάνωση με στόχο να βγάλει όσα περισσότερα παιδιά μπορούσε από τη φτώχεια και την εγκατάλειψη και να τους προσφέρει τη δυνατότητα «να σταθούν στα πόδια τους
Αξίζει να σημειωθεί ότι η απόφαση του ΕΔΔΑ ήταν ομόφωνη (συμφώνησε και η δικαστής από την Τουρκία) και ότι πρόκειται για την τρίτη κατά σειρά σχετική απόφαση με την οποία διατάσσεται η επιστροφή ακινήτου στον ελληνορθόδοξο ιδιοκτήτη του,
Η εμμονή του Σκοπιανού Αρχιεπισκόπου στο όνομα "Μακεδονία" προκαλεί πολλά ερωτηματικά καθώς έχει ξεκαθαριστεί από το Φανάρι ότι η ονομασία είναι προϋπόθεση για την αυτοκεφαλία .
