Σημείο αναφοράς για τους ορθοδόξους της Λιθουανίας θα είναι το Φανάρι και όχι η ρωσική Εκκλησία , όπως συνέβαινε μέχρι τώρα. Ωστόσο, τόσο κληρικοί της τοπικής Εκκλησίας όσο και κρατικοί αξιωματούχοι έχουν ζητήσει την εκκλησιαστική τους ανεξαρτητοποίηση.
Ο Πατριάρχης Θεόδωρος αποφάσιε να μην μνημονεύεται πλέον ο Πατριάρχης Μόσχας διακόπτοντας κάθε επικοινωνία με τον Κύριλλο μέχρι να ανακληθούν από τη Μόσχα τα «Εξαρχικά» όργανά του στην Αφρική