Η υπόθεση του Γιάννου Παπαντωνίου προκαλεί αντιπαράθεση μεταξύ ΝΔ και ΣΥΡΙΖΑ. Κύκλοι προσκείμενοι στην κυβέρνηση έλεγαν ότι ο γιός του πρώην υπουργού, Νικήτας Παπαντωνίου- Καρτάλης ήταν ένα από τα πρόσωπα που επιλέχθηκαν μέσω της διαδικασίας Μητρώου Στελεχών της Νέας Δημοκρατίας.
Πηγές της αξιωματικής αντιπολίτευσης, έλεγαν ότι πράγματι ο υιός Παπαντωνίου έχει περάσει τη διαδικασία του Μητρώου Σττελεχών, ωστόσο αυτό δε σημαίνει ότι θα είναι και υποψήφιος βουλευτής. Τόνιζαν ακόμα, πως, σε κάθε περίπτωση, δεν υπάρχει οικογενειακή ευθύνη.
Οι μόνοι που έχουν κλειδώσει για τα ψηφοδέλτια της ΝΔ είναι οι νυν βουλευτές, επεσήμαναν οι ίδιες πηγές.
Πάντως η ΝΔ, για την υπόθεση αυτή, δεν έμεινε μόνο στην άμυνα, αλλά πέρασε στην αντεπίθεση λέγοντας ότι αν στον ΣΥΡΙΖΑ θέλουν να μάθουν περισσότερα για τις μίζες στα εξοπλιστικά, μπορούν να απευθυνθούν στον κ. Κοτσακά, στενό συνεργάτη του Άκη Τσοιχατζόπουλου, ο οποίος ήρθε πρώτος ήρθε πρώτος, με 62 ψήφους, στην Πολιτική Γραμματεία του ΣΥΡΙΖΑ.
Να σημειωθεί πάντως, ότι η επιλογή του υιού Παπαντωνίου στο Μητρώο είχε προκαλέσει από την πρώτη στιγμή αντιδράσεις στο εσωτερικό της ΝΔ, (όχι για το θέμα των δικαστικών υποθέσεων του πατέρα του), αλλά για το γεγονός ότι ο Γιάννος Παπαντωνίου ήταν ένα κορυφαίο στέλεχος των κυβερνήσεων Σημίτη και στενός συνεργάτης του πρώην πρωθυπουργού.