Στο επίκεντρο θεσμικού διαλόγου βρίσκονται οι σχέσεις της Ευρωπαϊκής Εισαγγελίας (EPPO) με το ελληνικό Υπουργείο Δικαιοσύνης, μετά από δύο επιστολές που απέστειλε η Ευρωπαία Εισαγγελέας Λάουρα Κοβέσι στον υπουργό Γιώργο Φλωρίδη, καταθέτοντας τις απόψεις της για τη συμβατότητα διατάξεων της ελληνικής νομοθεσίας με το ευρωπαϊκό δίκαιο.
Στην πρώτη επιστολή, η οποία ακολούθησε τη συνάντησή τους στην Αθήνα, η κυρία Κοβέσι εισηγείται την κατάργηση του άρθρου 86 του Συντάγματος περί ποινικής ευθύνης υπουργών –ζήτημα που έχει ήδη τεθεί στο πλαίσιο της δημόσιας συζήτησης για τη συνταγματική αναθεώρηση. Η Ευρωπαία Εισαγγελέας υποστηρίζει ότι η συγκεκριμένη διάταξη περιορίζει τις αρμοδιότητες της EPPO και έρχεται σε αντίθεση με την αρχή της υπεροχής του δικαίου της Ε.Ε., το οποίο δεν προβλέπει ειδική μεταχείριση ή εξαιρέσεις για συγκεκριμένες κατηγορίες προσώπων.
Παράλληλα, στην επιστολή της επισημαίνει ότι η ελληνική νομοθεσία διαφοροποιεί τις εξουσίες παράστασης των Ευρωπαίων εντεταλμένων εισαγγελέων στα δικαστήρια ανάλογα με τη βαθμίδα που κατείχαν στο εθνικό σύστημα πριν από τον διορισμό τους.
Θέτει επίσης ζήτημα για την αποκλειστική ανάθεση της ανάκρισης κακουργημάτων σε εθνικό ανακριτή, θεωρώντας ότι οι παρεμβάσεις αυτού του τύπου από τις εθνικές αρχές δεν συνάδουν με τον κανονισμό της Ευρωπαϊκής Εισαγγελίας, η οποία έχει την αρμοδιότητα να ρυθμίζει τις δικαιοδοτικές εξουσίες των οργάνων της με σκοπό τη διασφάλιση της ταχύτητας των ερευνών.
Η δεύτερη επιστολή της κυρίας Κοβέσι εστάλη στις 19 Μαΐου, κατά τη διάρκεια της κοινοβουλευτικής διαδικασίας για την ψήφιση τροπολογίας που αφορά την επιτάχυνση της εκδίκασης ποινικών υποθέσεων για βουλευτές.
Η Ευρωπαία Εισαγγελέας εξέφρασε την αντίθεσή της στην αρχική μορφή της διάταξης, εκτιμώντας ότι απέκλειε τους Ευρωπαίους εισαγγελείς από τις έρευνες σε βάρος μελών του Κοινοβουλίου και ανέθετε την κύρια ανάκριση αποκλειστικά σε εθνικό ανακριτή. Για την άρση των αμφιβολιών αυτών, ο κ. Φλωρίδης προχώρησε σε βελτιωτική τροπολογία, διευκρινίζοντας ότι οι ανακριτικές αρμοδιότητες της Ευρωπαϊκής Εισαγγελίας παραμένουν πλήρως αμετάβλητες.
Παρά τη διόρθωση, η κυρία Κοβέσι διατήρησε τις επιφυλάξεις της, ασκώντας κριτική στον επείγοντα χαρακτήρα της νομοθέτησης και στις αυστηρές προθεσμίες ολοκλήρωσης των ερευνών, σημειώνοντας ότι οι ρυθμίσεις αυτές, εάν εφαρμόζονταν στην αρχική τους μορφή, θα μπορούσαν να επηρεάσουν την προστασία του προϋπολογισμού της Ε.Ε. στην Ελλάδα και την τήρηση των αρχών του κράτους δικαίου.